根據世界衛生組織的定義，健康是指生理上、心理上及社會上的完全安寧美好狀態，而不僅僅祇是免於疾病或虛弱。據資料顯示，健康是影響人們學習能力的主要因素。雖然大部份學校都有推行健康教育活動，但是教學及學習都只局限於用以應付公開考試的正規課程，忽略了健康教育對塑造及改善學生健康狀況的影響。健康教育應包含個人、家庭、學校及社會四個層面，並旨在推廣及維持健康知識、信念及行為，當然亦包括健康服務活動。在這方面，有效的健康推廣計劃必須有賴教育界、醫學界及社會的衷力合作。
如學校能營造一個舒適、寧靜及愉快的學習環境，就能塑造一群擁有健康體魄及優越成就的學生。相反，不注重健康行為的學生，在校會感到較為疏離及較易提早輟學，且較其他同輩不重視持續教育及終身學習的重要性。所以，在童年及青少年的關鍵階段，學校在健康教育及健康推廣方面所扮演的角色非常重要，除了要灌輸正確的知識外，亦要顧及學童的品格、價值觀、技能、態度及體能發展。
一九八六年，世界衞生組織於有關健康推廣的渥太華憲章中率先提出健康促進學校的概念。在一所健康促進學校裏，所有成員都會通力合作，致力讓學生享受愉快的經歷，而且學校的架構亦可協助推動及保障學生的健康狀況。學校以全面及全校性的政策去推廣個人、家庭及社區健康，而健康教育課程則與學校的健康服務、環境及校風互相配合。
本中心自1998年率先在香港推動「健康促進學校」的概念，並於2001年開始推行「香港健康學校獎勵計劃」(以下簡稱「獎勵計劃」) ，計劃以健康促進學校的概念為本，推動教育成就及身心之全面發展，從而改善學生的生活質素。計劃為學校提供一套完備的框架及指引，再通過完善的監察及認證制度協助學校落實發展「健康學校」的目標。
「獎勵計劃」根據1995年世界衞生組織成員國的指引，訂立了六個標準範疇(包括學校健康政策、健康服務、個人健康生活技能、校風/人際關係、社區關係及學校環境學校)，並已發展一套適用於香港的「健康學校」工作指引和標準，學校可因應校本的情況發展每個範疇。本計劃為香港首個獲得世界衞生組織西太平洋區認可及達致世界衞生組織標準的健康促進學校計劃，計劃設有金、銀、銅獎三級，學校必需達到獎勵級別所要求之標準才能獲獎。中心及香港特別行政區教育統籌局為獎勵計劃的頒發獎項機構。
為推動全港學校成為符合世界衞生組織標準的「健康促進學校」，中心將繼續發展「健康學校-夥伴學校計劃」、建立地區性「健康學校」網絡，以及為學校提供「健康促進學校」顧問及評估服務，致力促進香港「健康學校」的發展，配合學校、家庭和社區的資源及努力，共同為下一代建設健康成長環境。
中心每半年出版一份通訊刊物－《健康園丁》，旨在為推動健康教育及促進健康計劃的教育界同工提供交流及經驗分享平台。